五种尿液微生物组检测方法比较
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五种尿液微生物组检测方法比较
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AI 综述
Khemmani等研究者在孕妇无症状菌尿筛查的平行尿样中比较两种培养法和三种测序法,发现无PCR长读长shotgun宏基因组检出物种最多(528种),且是唯一能将大肠杆菌鉴定到物种水平的测序方法。 扩展定量尿液培养(EQUC)检出102种,高于标准尿培养(SUC)的41种;短读长V4 16S rRNA测序、长读长近全长16S rRNA测序和shotgun测序分别检出195、69和528种,显示不同方法对尿路微生物群的覆盖范围存在明显差异。
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最新进展11月3日 00:00
尿路微生物组检测:两种培养方法与三种测序方法的比较报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月3日
- bioRxiv · Bioinformatics尿路微生物组检测:两种培养方法与三种测序方法的比较
研究比较孕妇无症状菌尿筛查尿液的两种培养与三种测序方法,EQUC与测序检出物种数高于SUC。EQUC检出102种而SUC仅41种;短读长、长读长和shotgun分别检出195、69和528种,PCR-free长读长shotgun覆盖最广,且是唯一能将Escherichia coli鉴定到物种水平的测序方法。
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