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GEO公开肺癌耐药空间转录组数据

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AI 综述

NCBI GEO公开GSE342824,收录5例EGFR突变肺腺癌患者治疗前与进展期的配对FFPE肿瘤切片,共10张切片、1,516,917个分割细胞,用于研究奥希替尼耐药相关空间表达模式。 数据采用389重Xenium检测组合,包括289个预设靶标和100个补充基因,并提供各切片的原始及处理结果;其中1,400,257个细胞通过“转录本数大于10”的阈值,可用于细胞类型判定。匹配的单核RNA测序队列另存于GSE292469。

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报道时间线

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11月1日
  1. NCBI GEO · 每日新增数据集精选
    GSE342824:Xenium空间转录组数据刻画EGFR突变肺腺癌的osimertinib耐药模式

    GSE342824收录五例EGFR突变肺腺癌患者治疗前与进展期FFPE肿瘤切片的Xenium空间转录组数据。10张切片构成5组配对,采用包含289个预设靶标和100基因自定义补充的389-plex panel,共分段1,516,917个细胞。

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