ipSAE扩展至多类分子复合物评分
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ipSAE扩展至多类分子复合物评分
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AI 综述
Dunbrack R. 将用于预测复合物置信度的 ipSAE 扩展至蛋白质、核酸、小分子配体和原子离子相互作用,并公开免费代码;蛋白质—配体基准显示,其方向性评分比原生 ipTM 给出更宽的置信度范围,也能较好区分配体位置是否达到5 Å RMSD标准。 在102个由 AF3 和 Boltz-2 预测的蛋白质—配体复合物中,ipSAE 的评分范围更宽;在82个留出复合物上,以配体 RMSD 5 Å 为界,AF3采用0.5阈值、Boltz-2采用0.8阈值时,位置分类的平衡准确率分别为0.938和0.862。蛋白质—DNA基准支持该方向性评分方案,蛋白质—RNA基准规模较小,仅构成初步评估。
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最新进展11月3日 00:00
ipSAE以预测对齐误差方向性评估多类分子复合物报道时间线
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11月3日
- bioRxiv · BioinformaticsipSAE以预测对齐误差方向性评估多类分子复合物
Dunbrack R. 将ipSAE扩展到蛋白质、核酸、小分子配体和原子离子相互作用,并用AF3与Boltz-2的复合物预测评估方向性评分。
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