单细胞基础模型跨物种零样本迁移
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单细胞基础模型跨物种零样本迁移
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AI 综述
Trnovec等评估发现,Geneformer、scGPT和UCE无需重训练,即可在黏菌与线虫发育图谱中生成零样本嵌入,在与PCA、scVI的对比中恢复发育顺序并保留物种特异性细胞身份。 黏菌、线虫与人类的进化距离分别约为12亿年和6亿年。UCE按蛋白质序列编码基因,可使用97%的实测基因;Geneformer和scGPT经直系同源基因映射后使用不足五分之一。限制到可映射基因时,UCE在6项细胞注释任务中的5项仍高于基于词表的模型,但部分优势较小。
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最新进展10月31日 00:00
单细胞基础模型可跨超过 10 亿年的进化距离迁移报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月31日
- bioRxiv · Bioinformatics精选单细胞基础模型可跨超过 10 亿年的进化距离迁移
单细胞基础模型在无需重训练的情况下,可跨越与人类相隔超过 10 亿年的进化距离迁移,并恢复发育顺序、保留物种特异性细胞身份。
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