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单细胞基础模型跨物种零样本迁移

1 篇报道1 个报道来源2 天前更新

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AI 综述

Trnovec等评估发现,Geneformer、scGPT和UCE无需重训练,即可在黏菌与线虫发育图谱中生成零样本嵌入,在与PCA、scVI的对比中恢复发育顺序并保留物种特异性细胞身份。 黏菌、线虫与人类的进化距离分别约为12亿年和6亿年。UCE按蛋白质序列编码基因,可使用97%的实测基因;Geneformer和scGPT经直系同源基因映射后使用不足五分之一。限制到可映射基因时,UCE在6项细胞注释任务中的5项仍高于基于词表的模型,但部分优势较小。

AI 根据报道生成 · 10 小时前更新

报道时间线

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10月31日
  1. bioRxiv · Bioinformatics精选
    单细胞基础模型可跨超过 10 亿年的进化距离迁移

    单细胞基础模型在无需重训练的情况下,可跨越与人类相隔超过 10 亿年的进化距离迁移,并恢复发育顺序、保留物种特异性细胞身份。

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