粪便宿主转录组区分胃肠疾病
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粪便宿主转录组区分胃肠疾病
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AI 综述
Pan等研究团队报告,对涵盖结直肠癌、炎症性肠病、癌前病变和正常样本的285份粪便样本进行宿主RNA全转录组测序,中位恢复6300个蛋白编码基因;区分结直肠癌、炎症性肠病与正常样本的三分类模型AUC为0.94—0.96。 在炎症性肠病样本中,15基因中性粒细胞评分对内镜活动度的追踪优于同一粪便样本中的钙卫蛋白。研究于medRxiv发布,显示粪便宿主转录组可同时用于疾病区分和肠炎活动评估。
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最新进展11月2日 00:00
粪便宿主转录组揭示胃肠道诊断与监测中的肠上皮细胞状态和免疫动态报道时间线
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11月2日
- medRxiv · All粪便宿主转录组揭示胃肠道诊断与监测中的肠上皮细胞状态和免疫动态
研究团队对涵盖CRC、IBD、APL和正常样本的285份粪便文库进行宿主RNA全转录组测序,中位恢复6300个蛋白编码基因。三类模型区分CRC、IBD与正常样本的AUC为0.94-0.96,IBD中的15基因中性粒细胞评分追踪内镜活动度优于粪便钙卫蛋白。
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