校正Answer ALS蛋白质组批次效应
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校正Answer ALS蛋白质组批次效应
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AI 综述
Cooper等研究者校正了Answer ALS 1-2蛋白质组数据的批次效应，生成包含354个样本、3641种蛋白质的校正版数据集；研究称，批次效应已在全局和蛋白层面降低。 原数据集包含508个样本和3643种蛋白质。团队利用Answer ALS内部对照和BECA ComBat算法开展校正，BDC-ComBat是在全数据集上唯一成功降低批次效应的方法，并保留前六个主成分贡献蛋白中的4个；他们还构建了可用于其他大型数据仓库的校正流程。
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最新进展11月1日 00:00
批次效应校正提升公开 Answer ALS 蛋白质组数据集的可用性报道时间线
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11月1日
- bioRxiv · Bioinformatics批次效应校正提升公开 Answer ALS 蛋白质组数据集的可用性
研究团队校正 Answer ALS 1-2 蛋白质组数据集的批次效应，产出批次效应在全局及蛋白层面均降低的 354 samples by 3,641 proteins 新版本。BDC-ComBat 是唯一成功降低全数据集批次效应的方法，并保留前六个 PC 贡献蛋白中的四个；团队还构建了可应用于其他大型数据仓库的校正流程。
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