PixAQ改进IMC单细胞蛋白定量
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PixAQ改进IMC单细胞蛋白定量
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AI 综述
Chenyu Liang等在bioRxiv预印本提出PixAQ,通过标志物特异性概率像素归因改进影像质谱流式(IMC)单细胞蛋白定量;在三个队列、680个区域和366名患者中,其预期标志物占比较共享掩膜定量中位数提高1.99—4.83个百分点,与预定义群体—标志物关系的一致性更好。 PixAQ结合空间邻近性和锚点组强度模型,将像素—标志物观测分配给邻近细胞。消融分析显示两类证据均有贡献,且该方法不改变细胞分割。
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最新进展11月4日 00:00
PixAQ:单细胞蛋白质定量的标志物特异性像素归因报道时间线
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11月4日
- bioRxiv · BioinformaticsPixAQ:单细胞蛋白质定量的标志物特异性像素归因
PixAQ 以标志物特异性概率像素归因改进 IMC 单细胞蛋白定量,结合空间邻近性与锚点组强度模型,将像素—标志物观测分配给邻近细胞。三个队列 680 个区域、366 名患者中,预期标志物占比较共享掩膜定量提升 1.99–4.83 个百分点;消融分析显示空间与强度证据均有贡献,且不改变细胞分割。
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