Struct-Caliper校准蛋白质结构搜索

Shi等提出Struct-Caliper，通过表示感知的查询随机化构造背景查询，为蛋白质结构搜索生成查询特异性p值；在所测条件下，该方法提高了结构匹配回收率，并减少或未增加假发现。 在15,177个ASTRAL40结构的Foldseek搜索中，SG p值在cutoff 0.01下使同源回收提高18.2%，假发现略少于原生E值；对73个查询检索逾200万个AlphaFoldDB结构时，DALI支持的匹配平均回收率提高23.5%。模拟中，SG p值在所用随机化程序下通常将报告的假阳性控制在所选cutoff以内或以下。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。