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ARCADE解耦空间转录组丰度与状态

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AI 综述

Su, Q. 提出空间转录组计算框架ARCADE,用于分离细胞丰度与连续转录状态,减少不稳定单细胞参考和二者相互纠缠带来的分析不确定性。框架先通过超参数优化与共识过滤构建稳健参考,再估计细胞组成,并以该结果为锚点建模细胞内的连续转录程序。

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报道时间线

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11月3日
  1. bioRxiv · Bioinformatics
    ARCADE 解耦空间转录组中的细胞丰度与连续转录状态

    ARCADE 提出分阶段解耦细胞丰度与连续转录状态的空间转录组计算框架。框架先通过超参数优化和共识过滤构建稳健参考,再估计细胞组成,并以该结果为锚点建模细胞内连续转录程序。

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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。