Edi-Set-Flow批量RNA编辑分析流程
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Edi-Set-Flow批量RNA编辑分析流程
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AI 综述
Munro、Bahlo和Ansell在bioRxiv预印本中开发了Edi-Set-Flow,一套用于批量RNA-seq转录组范围A-to-I RNA编辑分析的端到端流程。 该流程基于Nextflow,以原始FASTQ为输入,依次完成读段修剪与质控、参考基因组比对,并用JACUSA2识别编辑位点;配套R包支持模型拟合、假设检验、假发现率控制和可视化,用于实验组间编辑比较。Munro等称,流程可扩展至数百或数千个样本,适用于GTEx等大规模数据,并可用于人和小鼠转录组。
AI 根据报道生成 · 9 小时前更新
最新进展11月3日 00:00
Edi-Set-Flow:大规模差异 RNA 编辑检测流程报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月3日
- bioRxiv · BioinformaticsEdi-Set-Flow:大规模差异 RNA 编辑检测流程
Munro、Bahlo 和 Ansell 在 bioRxiv 预印本中提出 Edi-Set-Flow,一套面向 bulk RNA-seq 的可复现、可扩展 A-to-I RNA 编辑分析流程。
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