GSE210787乳腺癌RNA-seq重分析
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GSE210787乳腺癌RNA-seq重分析
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AI 综述
Surisetty与Singh重新分析GSE210787中乳腺癌与正常组织的RNA-seq数据,在12个双端测序样本中筛得120个差异表达基因,其中肿瘤组织上调69个、下调51个。筛选标准为校正后P值<0.05且绝对log2倍数变化≥1。 上调基因的GO分析显示细胞周边富集,涉及29个重叠基因,P值约0.017585;多重校正后,KEGG通路均无显著富集。作者指出,解释结果时仍需核验样本元数据、DESeq2比较设计及富集分析参数。
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最新进展11月4日 00:00
GSE210787 乳腺肿瘤与正常组织 RNA-seq 数据的差异基因表达及功能富集重分析报道时间线
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11月4日
- bioRxiv · BioinformaticsGSE210787 乳腺肿瘤与正常组织 RNA-seq 数据的差异基因表达及功能富集重分析
重分析 GSE210787 的 12 个 RNA-seq 样本后,研究在乳腺肿瘤与正常组织间鉴定出 120 个差异表达基因:上调 69 个、下调 51 个。上调基因的 cell periphery(GO:0071944)富集含 29 个重叠基因,P 值约 0.017585;多重校正后 KEGG 无显著通路。
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