LoRA高效适配蛋白语言模型筛选抗菌肽
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LoRA高效适配蛋白语言模型筛选抗菌肽
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AI 综述
Jat与Ejaz提出基于ESM-2(150M)的多任务参数高效框架,将LoRA引入自注意力投影,仅微调约0.70%的模型权重,同时建模抗菌效力与哺乳动物细胞毒性。在训练—测试序列最大一致性不超过60%的QMAP基准划分上,抗菌效力与溶血毒性排序的相关系数分别为0.6132和0.5374。 论文称,该联合框架优于线性探针、树模型和冻结的基础模型;团队从749条从头设计肽中筛出治疗指数(TI)最高的候选,数值达144.03。
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最新进展11月3日 00:00
基于 ESM-2 的参数高效适配:严格同源性约束下的双靶点抗菌肽发现报道时间线
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11月3日
- bioRxiv · Bioinformatics基于 ESM-2 的参数高效适配:严格同源性约束下的双靶点抗菌肽发现
研究团队基于 ESM-2 (150M) 引入 LoRA,构建多任务框架并仅微调约 0.70% 的模型权重,同步优化抗菌效力与溶血毒性。在 QMAP 的 60% 最大序列一致性阈值下,E. coli 效力排序相关性达 ρ = 0.6132,溶血毒性达 ρ = 0.5374;框架从 749 条从头设计肽中筛出 TI 最高 144.03 的候选。
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