合成监督提升Borzoi变异效应预测
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合成监督提升Borzoi变异效应预测
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AI 综述
Wang等用模型生成的合成MPRA变异效应标签微调序列到功能模型Borzoi，将CAGI5启动子变异的Pearson相关系数从0.28提高至0.54，显示合成扰动监督可提升变异效应预测。 研究先由蒸馏模型为50至1,000个基因生成标签，每个基因600个变体，再用于微调Borzoi；纳入的训练基因越多，预测表现越好。在数据有限且变异总数相同的情况下，覆盖更多基因、减少每个基因的变异数，效果优于覆盖更少基因而给每个基因更多变异。
AI 根据报道生成 · 8 小时前更新
最新进展11月3日 00:00
合成 MPRA 扰动监督提升 Borzoi 的变异效应预测报道时间线
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11月3日
- bioRxiv · Genomics合成 MPRA 扰动监督提升 Borzoi 的变异效应预测
研究团队用合成 MPRA 变异效应标签微调 Borzoi，将 CAGI5 启动子变异的 Pearson correlation 从 0.28 提升至 0.54。
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