HiFiTaxa扩增子分析流程预印本
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HiFiTaxa扩增子分析流程预印本
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AI 综述
Garritano、Modolon、Warren 等作者在 bioRxiv 发表预印本，提出并评测 HiFiTaxa：这是一套面向 PacBio HiFi 16S rRNA 基因和真菌 ITS 扩增子测序、可由单条命令运行的可复现 Nextflow 流程。 流程从当前 GTDB 和 UNITE 数据库构建带版本参考，支持 BLCA 与朴素贝叶斯分类器，并可分别用 Emu（16S）和 EMITS（ITS）进行读段级分析；作者以模拟群落及留出 10% GTDB 或 UNITE 序列的测试集完成基准评测。
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最新进展11月4日 00:00
HiFiTaxa：面向 PacBio 长读长全长 16S rRNA 基因与真菌 ITS 扩增子测序的可复现分析流程报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
11月4日
- bioRxiv · BioinformaticsHiFiTaxa：面向 PacBio 长读长全长 16S rRNA 基因与真菌 ITS 扩增子测序的可复现分析流程
HiFiTaxa 是面向 PacBio HiFi 16S rRNA 基因与真菌 ITS 扩增子测序的单命令 Nextflow 流程，基于当前 GTDB 与 UNITE 参考，支持 BLCA 与 NB 分类器及 Emu、EMITS 读段级分析。
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