SQANTI-evidence用长读长注释基因组
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SQANTI-evidence用长读长注释基因组
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AI 综述
P. Atienza Lopez与A. Conesa提出并评测SQANTI-evidence，使未注释基因组可仅凭长读长RNA-seq获得转录本异构体和UTR注释，无需参考注释或蛋白数据库。 其中，经SQANTI3校订的转录本以观测形式纳入注释，并标出异构体和UTR；没有读段支持的位点由AUGUSTUS预测基因。作者在13个ERGA数据集上进行了注释。
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最新进展11月4日 00:00
SQANTI-evidence 为未注释基因组提供转录本异构体解析和证据分层注释报道时间线
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11月4日
- bioRxiv · BioinformaticsSQANTI-evidence 为未注释基因组提供转录本异构体解析和证据分层注释
P. Atienza Lopez 与 A. Conesa 提出 SQANTI-evidence 工作流，仅凭长读长 RNA-seq 为未注释基因组生成转录本异构体和 UTR 注释，无需参考注释或蛋白数据库。
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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。