bioRxiv · Bioinformatics· Kao, T.-Y., Meiler, J., Mchaourab, H. S. ·· 2 天前AI 评分55
可微自旋中心扩散模型驱动DEER引导的加权蛋白构象集合生成流程
Differentiable Spin-Center Diffusion Model Enables DEER-Guided Generative Pipeline of Weighted Protein Ensembles
AI 导读
研究团队开发了可微的自旋中心扩散模型,并与冻结的Boltz-2结构生成器结合,使完整DEER距离分布能在推理时引导加权蛋白构象集合生成。在已知组成的合成P(r)上,该流程恢复了ensemble populations,包括双峰分布的两个组分。团队还依据不同生化条件下的实验P(r),对PfMATE、LmrP、MhsT和P-glycoprotein进行建模,并从集合中推导条件依赖的自由能差异。
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