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bioRxiv · Bioinformatics· WEIZMANN, Z., VENTRE, E. ·· 2 天前AI 评分56

GSET 从嵌入轨迹基因信号中筛选紧凑基因集以进行机制性 GRN 推断

GSET: Gene Signals from Embedding Trajectories select compact contexts for mechanistic GRN inference

AI 导读

GSET 提出一种位于机制性 GRN 推断上游的动态检索框架,从时间序列基因嵌入中提取最优传输残差和 KL 散度信号。在合成基准的相同基因预算下,该方法恢复的程序间调控链接多于同等规模的静态选择,集合内边的推断表现与全基因模型在同一基因对上相当。

来源:bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org