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bioRxiv · Bioinformatics· Ozier-Lafontaine, A., Dray, N., Villoutreix, P., Cantini, L. ·· 3 天前AI 评分40

Kontext:连接空间域识别与细胞间通信的核方法

Kontext: Kernel-based method bridging spatial domain identification and cell-cell communication

AI 导读

Kontext 以核方法联合表示细胞与局部环境,在空间转录组中识别空间域,并基于配体-受体互作解释机制;参考域注释恢复优于最先进方法。在 Xenium 小鼠心脏冷冻损伤中,Kontext 解析成纤维细胞与巨噬细胞间的持续补体活动;在 million-cell 三维 Open-ST 转移性淋巴结中界定肿瘤—微环境边界。

来源:bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org