bioRxiv · Bioinformatics· Macha, N., Arrieta-Lobo, M., Lillo, S., Dartigues, B., Chalopin, D., Saleh, M., Daubon, T. ·· 1 天前AI 评分68
TileScope 量化空间基因表达的区域相关与边界组织
TileScope quantifies spatial gene expression relationships beyond colocalization
AI 导读
研究团队提出空间分析框架 TileScope,结合区域富集、区域内相关、跨距离互相关和边界表达差异,描述基因与转录程序在组织区域中的关系。在30个由胶质母细胞瘤和肝细胞癌数据构建的受控场景中,该框架区分了重叠斑块、梯度和边界定位表达,并在30个人胶质母细胞瘤切片中识别出边界处富集的缺氧相关表达。
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