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bioRxiv · Bioinformatics· He, D., Patro, R., Nassar, M., Wu, H., Yan, Q., Xu, G., Torkenczy, K., Liu, J., Tyanova, S. ·· 2 天前精选AI 评分72

scRM:以 scRNA-seq reads 训练的单细胞基础模型

scRM: A single-cell foundation model trained on scRNA-seq reads

AI 导读

研究团队提出 scRM,据其所知,这是首个直接在 scRNA-seq reads 上训练的单细胞基础模型。结果显示,原始数据预训练不仅可行,还能以 count models 一小部分的计算成本保持竞争力。源代码已公开:https://github.com/altos-labs/scRM。

推荐理由

原文展示以 sequencing reads 预训练单细胞基础模型的可行性,并比较其与 count models 的计算成本,为评估原始数据路线提供参考。

来源:bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org