EMBER：上下文化基因表征预测单个及组合细胞扰动效应

Ho、Xing与Ma提出基因中心基础模型EMBER，其上下文化基因表征相较评测基线改善了跨情境扰动响应预测和遗传互作排序。该模型在按细胞类型和实验批次平衡采样的多样化单细胞语料上，结合交互引导的对比学习和掩蔽表达重建进行预训练。冻结的预训练编码器可配合轻量探针，支持单基因扰动响应、双基因互作和多靶点药物响应预测，并将SCFD1列为mTOR抑制期间的候选依赖因子。